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Bannière - Faculté des études supérieures et postdoctorales
 
Le Département de biochimie, microbiologie et immunologie situé dans la Faculté de médecine offre des programmes d’études supérieures de maîtrise (M.Sc.) et de doctorat (Ph.D.) en biochimie.

L’objectif des programmes est de préparer les candidats à des carrières d’enseignement postsecondaire ou de recherche dans le secteur public ou privé. Les étudiants diplômés sont activement impliqués dans la recherche de laboratoire, les cours, les séminaires et la diffusion des résultats de leur recherche dans des colloques scientifiques. Les programmes créent un environnement stimulant qui va permettre aux étudiants d'acquérir l'excellence en recherche. Les diplômés des programmes doivent démontrer de bonnes compétences en recherche et une crédibilité en tant que professionnels dans leur domaine.

Les professeurs membres du département sont impliqués dans trois champs de recherche principaux: la biochimie générale; la biologie moléculaire; et la nutrition et le métabolisme. De plus amples renseignements sont affichés sur le site web départemental.

Le département participe aux programmes pluridisciplinaires suivants : le programme de bioinformatique (au niveau de la maîtrise), le programme de génétique humaine et moléculaire (au niveau de la maîtrise et du doctorat) et le programme de pathologie et médecine expérimentale (au niveau de la maîtrise et du doctorat).

Le programme de doctorat participe au programme combiné de diplômes en médecine et en philosophie (M.D. / Ph.D). Pour de plus amples renseignements, voir le site de la Faculté de Médecine.

Presque tous les cours de ces programmes sont offerts en anglais. Les activités de recherche peuvent se dérouler soit en anglais soit en français soit dans les deux langues en fonction de la langue principale du professeur et des membres du groupe.

Conformément au règlement de l’Université d’Ottawa, les travaux, les examens, les mémoires et les thèses peuvent être rédigés en français ou en anglais.

Les programmes sont régis par les règlements généraux de la Faculté des études supérieures et postdoctorales (FÉSP).

Rechercher les domaines de recherche du corps professoral

Les professeurs inclus dans la liste ci-dessous sont membres de la Faculté des études supérieures et postdoctorales. Cela signifie qu’ils sont autorisés à diriger ou à co-diriger des thèses. Une liste complète des membres du corps professoral et du personnel associés au programme se trouve au http://www.med.uottawa.ca/grad/fra/07-contactez_nous.html




ADDISON, Christina, Professeure avec affectation multiple
Angiogenisis; cancer; extracellular matrix

AGUER, Céline, Professeure auxiliaire
Muscle metabolism, myokines, type 2 diabetes, physical activity

ALAIN, Tommy, Professeur adjoint
Apoptosis; Cancer Research; Infectious Diseases; Oncology; Pediatric Cancer; Programmed Cell Death.

ALTOSAAR, Illimar, Professeur titulaire
Biotech foods as global medicines

BAENZIGER, John, Professeur titulaire
Nicotinic receptors; membrane proteins; structure/function, crystallization; biophysics; lipid-protein interactions

BAETZ, Kristin, Professeure titulaire
Génomique fonctionnelle

BELL, John, Professeur avec affectation multiple
Ocolytic viruses; protein translation; cancer therapeutics

BENNETT, Steffany, Professeure agrégée
Neuroregeneration; degeneration; apoptosis; stem cells; Gap junctions; Alzheimer's; transgenic mouse models; Neural Regeneration; Lipidomics

BERTINATO, Jesse, Professeur auxiliaire
Nutrition, mineral status and metabolism, nutrition standards

BICKEL, David, Professeur avec affectation multiple
Analyses de données d'expression de gènes; reconstruction de réseaux moléculaires; méthodologie de validation de modèles; inférence Bayesienne et empirique Bayes; algorithmes d'apprentissage et simulations Monte Carlo

BLAIS, Alexandre
Our lab studies the six family of transcription factors and the critical role its members play in muscle development; we are interested in understanding, at the molecular level, the mode of action of these transcription factors

BOYCOTT, Kym Marie, Professeure avec affectation multiple

BULMAN, Dennis, Professeur avec affectation multiple
Human genetics; linkage analysis; disease gene identification; myoclonus dystonia; Parkinson's; brachydactyly

CHAKRABORTY, Pranesh

CHRÉTIEN, Michel, Professeur avec affectation multiple
Neural and hormonal peptides; proprotein convertases; atherosclerosis; diabetes; Alzheimer's

COCKELL, Kevin, Professeur auxiliaire
Nutrition; mineral nutrients; metabolic interactions

COUTURE, Jean-François, Professeur adjoint
Genetic information is packaged into a chromatin polymer which must be opened to increase the accessibility of gene regulatory factors, or compacted to restrict the access of the transcriptional machinery to target genes

DIALLO, Jean-Simon, Professeur auxiliaire

DIMITROULAKOS, Jim, Professeur avec affectation multiple
Experimental therapeutics; cancer; targeted therapy

FAIRHEAD, Todd, Professeur avec affectation multiple

FIGEYS, Daniel, Professeur titulaire
Technologie en protéomique et applications en biologie des systèmes

FULLERTON, Morgan, Professeur adjoint

GRAY, Douglas, Professeur avec affectation multiple
Proteins inside cells are normally degraded through elaborate and highly regulated cellular machinery; and failure to do so underlies many disease states, we are studying the role of protein degradation in neurodegenerative diseases; lung cancer and aging; these conditions are studied using transgenic mice

HARPER, Mary-Ellen, Professeure titulaire
Mitochondrial energetics; uncoupling proteins; metabolic regulation; obesity and diabetes

HEFFORD, Mary Alice, Professeure auxiliaire

HOLCIK, Martin, Professeur avec affectation multiple
Apoptosis; cancer; IAP; translational control; RNA binding proteins; signal transduction

IOSHIKHES, Ilya, Professeur agrégé
Regulation transcriptionnelle de l'expression génique; positionnement nucléosomique comme élément essentiel de la régulation génique; régulation des micro-ARNs.

KUROSKI DE BOLD, Mercedes L, Professeure avec affectation multiple

LABOW, Rosalind, Professeure avec affectation multiple
Biomaterials; cell signaling in macrophages on material surfaces during tissue regenerations

LAGACE, Thomas, Professeur avec affectation multiple
Atherosclerosis, Genetics and Cell Biology ; Lipoprotein Receptor Biology

LANEUVILLE, Odette, Professeure titulaire
Understanding the regulation of expression of the enzyme cyclooxygenase

LEE, Hoyun, Professeur avec affectation multiple
Contrôle du cycle cellulaire; réplication de l'ADN; cancer

LIU, Qing Yan, Professeur auxiliaire
Molecular genetics; genomics; apoptosis; neurodegeneration; DNA microarray; bioinformatics

LIU, Xingquan Johne, Professeur auxiliaire
Régulation hormonale de la maturation d'un oeuf; action non génomique de la progestérone dans l'oocyte du Xenopus

LORIMER, Ian A.J., Professeur avec affectation multiple
Une thérapie du cancer visant un récepteur EGF oncogénique

MACFARLANE, Amanda, Professeur auxiliaire
Folic acid metabolism; Inflammation and cancer; Fetal origins of disease; Epigenetics

MACKENZIE, Alexander, Professeur avec affectation multiple
Atrophie musculaire spinale (SMA); rôle du peptide inhibiteur de l'apoptose neuronale (NAIP)

MCBURNEY, Michael, Professeur avec affectation multiple
Mécanismes moléculaires de l'inactivation des gènes chez les cellules mammifères

MCPHERSON, Phyllis, Professeure avec affectation multiple
Régulation des récepteurs des HDL; le trafic du cholestérol

MEZL, Vasek, Professeur agrégé
Vitamin E (-tocopherol); regeneration of Vitamin E

MILNE, Ross, Professeur avec affectation multiple
Structures des récepteurs LDL et des lipoprotéines qui leur permettent d'agir l'un sur l'autre

NEMER, Mona, Professeure titulaire
Molecular mechanisms involved in cellular growth and differentiation, particularly as this relates to heart failure and congenital heart diseases

PELCHAT, Martin
Produits impliqués dans la réplication des ARN subviraux pathogènes

PERKINS, Theodore, Professeur auxiliaire
Bioinformatique, apprentissage machine, cellules souches, biologie du cancer

PEZACKI, John P., Professeur auxiliaire
Recherche en biologie chimique et virologie

RAYNER, Katey
microRNA, atherosclerosis, inflammation, macrophages, obesity, cholesterol

ROSU-MYLES, Michael, Professeur auxiliaire
Stem cells, flow cytometry, health product evaluation

RUDNER, Adam, Professeur adjoint
Chromosome structure and dynamics; yeast genetics; cell cycle regulation

SCOTT, Fraser, Professeur titulaire
Modification alimentaire du diabète de type 1; composants bioactifs de la nourriture

SKERJANC, Ilona, Professeure titulaire
Développement du coeur et du muscle; cellules souche; expression des gènes

SORISKY, Alexander, Professeur avec affectation multiple
L'obésité; la différentiation des adipocytes; l'action de l'insuline; l'apoptose; le diabète

STEWART, Alexandre, Professeur avec affectation multiple
Inherited cardiovascular disorders; genetic risk factors for Coronary Artery Disease

STINTZI, Alain, Professeur agrégé
Génomique microbienne, campylobacter jejuni; iron acquisition and metabolism; and stress responses

TANPHAICHITR, Nongnuj, Professeure avec affectation multiple
La reproduction des mammifères; les contraceptifs; la biotechnologie de la reproduction

TRUDEL, Guy, Professeur titulaire

VINCENT, Renaud, Professeur auxiliaire
Toxicologie de l'environnement; pathologie; protéomique; toxicologie de l'inhalation

WOULFE, John, Professeur avec affectation multiple
Neurodegenerative dementias; (Alzheimer's disease and non-Alzheimer's frontotemporal dementias); Parkinson's disease and the synucleinopathies; pathogenesis of certain neurodegenerative disorders

YAO, Zemin, Professeur titulaire
Factors required for hepatic assembly and secretion of apoB-containing lipoproteins; the LDL-receptor binding domain(s) within human apoB100; mechanisms responsible for the intracellular degradation of newly synthesized apoB, Structure/function relationships within LRP (the LDL-receptor Related Protein) and its potential role in post-prendial fat absorption by the adipose tissue

ZHA, Xiaohui, Professeure avec affectation multiple
La microscopie fluorescente; le trafic membranaire; le cholestérol

L’admission au programme d’études supérieures en biochimie est régie par les règlements généraux de la FÉSP.

Pour être considéré, il faut :

  • Être titulaire d’un baccalauréat spécialisé ou avec majeure (ou l’équivalent) en sciences, ou d'un diplôme en médecine (M.D.), ou d'un diplôme en médecine vétérinaire (D.M.V.) avec une moyenne minimale de B+ (75%).
  • Démontrer une bonne aptitude à la recherche que ce soit dans le contexte d’un projet de quatrième année au baccalauréat ou par la rédaction de rapports de recherche, de résumés ou d’autres documents démontrant des habiletés de recherche.
  • Fournir au moins deux lettres de référence confidentielles de professeurs familiers avec l’étudiant et son travail.
  • Fournir une lettre de motivation indiquant les intérêts intellectuels, les objectifs de carrière et autres facteurs pertinents au domaine de recherche.
  • Identifier au moins un professeur prêt à diriger la recherche et la thèse du candidat.
  • Maîtriser (comprendre, parler et écrire) l'anglais. Presque tous les cours du programme sont offerts en anglais. Les activités de recherche peuvent se dérouler soit en anglais soit en français soit dans les deux langues en fonction de la langue principale du professeur et des membres de son groupe de recherche.

Le département peut, selon les antécédents du candidat, imposer des cours additionnels.

Programme pluridisciplinaire en bioinformatique au niveau de la maîtrise

Le département de biochimie, microbiologie et immunologie est l’une des unités scolaires participant au programme pluridisciplinaire en bioinformatique au niveau de la maîtrise. Il faut indiquer dans la demande d’admission initiale qu’on veut être accepté dans ce programme. Le directeur de thèse doit être membre du programme. Pour de plus amples renseignements, voir la description du programme de bioinformatique affichée sur le site web de la FÉSP.

Programme pluridisciplinaire en génétique humaine et moléculaire au niveau de la maîtrise et du doctorat

Le département de biochimie, microbiologie et immunologie est l’une des unités scolaires participant au programme pluridisciplinaire en génétique humaine et moléculaire au niveau de la maîtrise et du doctorat. Il faut indiquer dans la demande d’admission initiale qu’on veut être accepté dans ce programme. Le directeur de thèse doit être membre du programme. Pour de plus amples renseignements, voir la description du programme de génétique humaine et moléculaire affichée sur le site web de la FÉSP.

Programme pluridisciplinaire en pathologie et médecine moléculaire au niveau de la maîtrise et du doctorat

Le département de biochimie, microbiologie et immunologie est l’une des unités scolaires participant au programme pluridisciplinaire en pathologie et médecine expérimentale au niveau de la maîtrise et du doctorat. Il faut indiquer dans la demande d’admission initiale qu’on veut être accepté dans ce programme. Le directeur de thèse doit être membre du programme. Pour de plus amples renseignements, voir la description du programme de pathologie et médecine expérimentale affichée sur le site web de la FÉSP.

M.Sc. en biochimie

Les exigences à remplir pour la M.Sc. en biochimie sont :

  • Réussite du cours obligatoire MED8566 Attitude et compétences professionnelles.
  • Réussite de 6 crédits BCH approuvés de niveau 8000 et plus.
  • Réussite du séminaire (BCH5366); ceci implique la présentation d'un séminaire et la participation à tous les séminaires du département jusqu'à l'obtention de la permission d'écrire la thèse.
  • Présentation et soutenance réussie d'une thèse (BCH7999) basée sur des travaux de recherche originaux effectués sous la direction immédiate d'un membre du corps professoral.
  • La note de passage dans tous les cours est de C+. Les étudiants qui échouent deux cours (équivalent à 6 crédits), le projet de thèse ou dont le rapport de progrès dans la recherche est jugé insatisfaisant doivent se retirer du programme.

Selon l’expérience antérieure de l’étudiant, le département peut imposer des cours additionnels. Pour suivre des cours dans des disciplines connexes, il faut au préalable obtenir la permission du département.

Programme pluridisciplinaire en bioinformatique

Il faut remplir à la fois les exigences de la M.Sc. en biochimie et celles du programme pluridisciplinaire en bioinformatique.

  • 3 crédits obligatoires en bioinformatique (BNF5506/BIO5106).
  • Réussite du séminaire de bioinformatique (BNF6500), qui comporte la remise d'un rapport écrit, la présentation d'un séminaire et l'assiduité à la série de séminaires offerte par le département.
  • Présentation et soutenance réussie d'une thèse de recherche en bioinformatique basée sur des travaux de recherche originaux effectués sous la direction d'un membre du corps professoral participant au programme conjoint en bioinformatique.
  • La note de passage dans tous les cours est de B. Les étudiants qui échouent 6 crédits, ou dont le rapport de progrès est jugé insatisfaisant doivent se retirer du programme.

Selon l'expérience antérieure de l'étudiant, le département peut imposer des cours additionnels.

Programme pluridisciplinaire en génétique humaine et moléculaire

Il faut remplir à la fois les exigences de la M.Sc. en biochimie et celles du programme pluridisciplinaire en génétique humaine et moléculaire.

  • Six crédits de cours, dont trois dans le programme principal et trois dans le programme HMG.
  • Inscription au séminaire, présentation obligatoire d'un séminaire et participation à toute la série de rencontres dans le programme principal.
  • Présentation et soutenance d'une thèse faisant état d'une recherche originale et dirigée par un membre du programme pluridisciplinaire.
  • La note de passage dans tous les cours est de C+. Les étudiants qui échouent deux cours (équivalent à 6 crédits) doivent se retirer du programme.

Les candidats à la maîtrise voulant passer directement au doctorat doivent remplir les conditions précisées par leur programme principal.

Le choix de cours est sujet à l'approbation du directeur du programme HMG.

Programme pluridisciplinaire en pathologie et médecine expérimentale

Il faut remplir à la fois les exigences et les règlements du programme principal et ceux du programme pluridisciplinaire.

Les exigences spécifiques au programme pluridisciplinaire sont les suivantes :

  • Un cours (3 crédits) dans le programme principal.
  • Un cours (3 crédits) dans la spécialisation en pathologie et médecine expérimentale.
  • Réussite du séminaire en pathologie et médecine expérimentale.
  • Présentation et soutenance réussie d'une thèse en pathologie et médecine expérimentale basée sur des travaux de recherche originaux effectués sous la direction d’un professeur membre du programme pluridisciplinaire en pathologie et médecine expérimentale. Au moins un des examinateurs de la thèse doit être membre du programme pluridisciplinaire en pathologie et médicine expérimentale.
  • La note de passage dans tous les cours est de C+. Les étudiants qui échouent deux cours (équivalent à 6 crédits) doivent se retirer du programme.

Passage accéléré de la maîtrise au doctorat

Les étudiants exceptionnels inscrits au programme de maîtrise peuvent être promus au programme de doctorat sans rédiger une thèse de maîtrise. Pour de plus amples renseignements, veuillez consulter la section « Admission » du programme de doctorat.

Durée du programme

On s’attend à ce que les étudiants remplissent toutes les exigences dans une période de deux ans. Le délai maximum permis est de quatre ans à partir de la date initiale d’inscription au programme.

Résidence

Il faut s'inscrire à un minimum de trois sessions à temps plein.

Tous les cours ne sont pas nécessairement offerts chaque année. Les cours sont offerts dans la langue dans laquelle ils sont décrits.

Not all of the listed courses are given each year. The course is offered in the language in which it is described.

BCH5101 ANALYSIS OF –OMICS DATA (3cr.)
Theoretical and practical aspects of various methods currently used to analyze the plethora mountain of –omics data. Methods: sequence alignment and database searches; sequence analysis and bioinformatics of gene regulation; DNA microarray and sequencing technologies to identify transcription factor binding sites; analysis of proteomics data; statistical analysis of preprocessed gene expression and protein/metabolite abundance data; epidemiology applications. Critical reading of the literature and strategies for making informed choices of methods for the analysis of students’ own data. Prerequisites: BCH2333, BCH3170.

BCH5366 MSc SEMINAR (3cr.)
Attendance and participation in the annual BMI Student Symposium and BMI Poster Day, attendance at BMI seminars relevant to Biochemistry. Students must present at least one poster and one oral presentation during the course of their program. Graded S/NS

BCH5501 ANALYSE DES DONNÉES –OMIQUES (3cr.)
Les aspects théoriques et pratiques des méthodes actuellement utilisées pour l’analyse des données –omiques. Méthodes : alignement des séquences et recherche dans les bases de données; analyse des séquences et bioinformatique de l’expression génique; micro puces d’ADN et technologies de séquençage utilisées pour l’identification des sites de liaison des facteurs de transcription; l’analyse des données protéomiques; l’analyse statistique de l’expression génique prétraitée; et applications aux données protéine/abondance de métabolites, épidémiologie. Lecture critique de la littérature et stratégies pour faire des choix informés quant à la sélection des méthodes pour l’analyse des données. Préalables : BCH2333, BCH3170.

BCH7999 RECHERCHE POUR LA THÈSE DE MAÎTRISE / MSC THESIS RESEARCH
À l'intention des étudiants faisant de la recherche en vue de l'obtention de la maîtrise. Les étudiants doivent soumettre au Département un plan détaillé de la recherche qu'ils se proposent de faire. Chaque année une rencontre avec un comité consultatif doit avoir lieu et un rapport de progrès doit être soumis au Département. / For students doing research leading to the MSc degree. Students are responsible for ensuring that a detailed outline of the proposed research is on file with the Department and that they have an annual meeting with an advisory committee. Yearly progress reports must also be submitted to the Department.

BCH8101 PHYSICAL AND CHEMICAL METHODS IN BIOCHEMISTRY (3cr.)
Current applications of physical and chemical methods to the study of macromolecule structure-function relationships.

BCH8102 SELECTED TOPICS IN PROTEIN STRUCTURE AND FUNCTION (3cr.)
An advanced study of recent literature dealing with structure-function relationships in selected proteins.

BCH8103 ADVANCED TOPICS IN GENE EXPRESSION AND PROTEIN SYNTHESIS (3cr.)
An advanced study of the recent literature dealing with the chemistry, metabolism and function of nucleic acids, the biosynthesis of proteins, biochemical and genetic control mechanisms, genetic engineering and the control of gene expression. Offered every second year in alternation with BCH8105. Prerequisite: BPS 4101 or equivalent with the permission of the instructor.

BCH8104 ADVANCED TOPICS IN CELL REGULATION (3cr.)
An advanced study of recent literature dealing with signal transduction processes and the regulation of metabolism, cell proliferation and differentiation.

BCH8105 ADVANCED TOPICS IN MOLECULAR BIOLOGY OF HUMAN DISEASES (3cr.)
Topics will be selected and representative of current developments in the field. The course consists of a repeated series of a 3 hour lecture by an expert in the field one week, followed by student presentations, discussions and critique of assigned papers on that topic the following week. Topics on selected diseases will focus on various aspects of cancer, apoptosis, disease gene identification and gene therapy. In the past these topics have included the molecular aspects of various cancers, spinal muscular atrophy, tissue regeneration, the discovery of disease genes, infectious disease (HIV) and gene therapy. Students will write a grant proposal and participate in mock grant review panels. Depending on enrolment, the course may be limited to HMG students only. Prerequisite: Permission of the HMG program director.

BCH8106 ADVANCED TOPICS IN NUTRITION AND REGULATION OF METABOLISM (3cr.)
An advanced study of the recent literature dealing with metabolism, nutrition and metabolic control theory, with emphasis on both whole body and cell metabolism in metabolic and nutritional disorders such as obesity and non-insulin-dependent diabetes mellitus (NIDDM).

BCH8107 ADVANCED TOPICS IN STRUCTURE AND FUNCTION OF PLASMA LIPOPROTEINS (3cr.)
Recent advances in our knowledge of the plasma lipoproteins with a special emphasis on their role in the etiology of atherosclerosis. The subject will be introduced by an overview of the general structural properties of lipoproteins which will be followed by detailed discussion of the structure, metabolism and genetics of the apolipoproteins, the proteins and enzymes that modify lipoproteins and cell surface lipoprotein receptors. Other topics will include cholesterol homeostasis, plasma cholesterol transport and disorders of lipoprotein metabolism.

BCH8108 ADVANCED METHODS OF MACROMOLECULAR STRUCTURE DETERMINATION (3cr.)
A detailed examination of modern methods used to determine the structures of proteins, nucleic acids, and carbohydrates. May include X-ray crystallography, electron diffraction, nuclear magnetic resonance, and other spectroscopic methods.

BCH8109 ADVANCED TOPICS IN CELL DEATH (3cr.)
Molecular mechanisms of cell death. Particular attention to be paid to role of aberrant cell death in human disease. Offered in the Fall of odd numbered years.

BCH8110 ADVANCED TOPICS IN SYSTEMS BIOLOGY (3cr.)
Recent advances in genomics, proteomics, bioinformatics, and neuroinformatics including functional and chemical genomics, RNA analyses, microarrays, mass spectrometry, and neural imaging. Course requirements include student presentations and writing a mock research proposal based on Canadian Institutes of Health Research (CIHR) guidelines. Limited enrollment. Offered in alternate years with BCH 8101 Physical and Chemical Methods in Biochemistry. Prerequisite: Permission of the program director.

BCH8111 CHROMOSOME AND CHROMATIN BIOLOGY (3cr.)
Higher order chromosome structure and chromatin remodeling and their impact on regulation of gene expression, DNA replication, repair and recombination, and chromosome segregation. Histone modifications and nucleosome positioning and their influence on higher order chromosome structure. Importance of chromosome and chromatin in the context of the cell cycle, development, and disease. Critical reading of the literature on chromosome and chromatin biology.

BCH8114 ADVANCED TOPICS IN THE CELL CYCLE (3cr.)
Mechanisms of cell cycle regulation. Model systems critical to deciphering the cell cycle in eukaryotes: budding and fission yeast, Xenopus laevis egg extracts, Aspergillus nidulans, Drosophila melanogaster, sea urchin and mouse oocytes and cultured vertebrate cells. Overview of the prokaryotic cell cycle.

BCH8116 MODEL ORGANISMS AND SYSTEMS BIOLOGY (3cr.)
Utilization of model organisms in the development and advancement of the systems biology field. Particular attention will be paid to the use of organisms such as Saccharomyces cerevisiae as a model platform for cell cycle progression/cancer. Other models may also be included. The basics of the technology will be discussed along with the application of technology to complex biological questions, in particular relating to the cell cycle. Course offered in alternate years.

BCH8117 ADVANCED TOPICS RELATING TO THE CELL CYTOSKELETON AND MEMBRANES (3cr.)
Advanced study of recent literature dealing with the mammalian cellular cytoskeleton and membrane with an emphasis on the regulation of cell motility, adhesion and cell division.

BCH8134 STRUCTURE AND EXPRESSION OF EUKARYOTIC AND PROKARYOTIC GENOMES (3cr.)
Sequencing of eukaryote and prokaryote genomes with emphasis on recent technologies, sequence alignments and databases and assembly of genomes from massively parallel sequencing data. Focus on mapping studies, including linkage disequilibrium-based genome-wide association study (GWAS), to characterize functional variants associated with complex traits. Analysis and structure of microbial metagenomes from environmental and human habitats, including structure-function analysis of microbial communities, microbiota-human disease correlations, and molecular phylogeny. Genome expression, including measures of RNA transcripts and proteins and statistical analysis of data. Combination of various -omics data to understand gene-environment interactions.

BCH8165 SPECIAL TOPICS IN BIOCHEMISTRY I (2cr.)
A survey of recent advances in selected areas of biochemistry.

BCH8166 SPECIAL TOPICS IN BIOCHEMISTRY II (2cr.)
A survey of recent advances in selected areas of biochemistry.

BCH8310 CURRENT TOPICS IN RNA MOLECULAR BIOLOGY (3cr.)
Properties, mechanisms associated with regulation and the functions of RNAs and Ribonucleoprotein (RNPs) as well as RNA organisms. Current knowledge on RNA expression (synthesis, processing, transport and localization), the structure-function relationship and molecular mechanisms associated with RNAs and RNA genomes, RNA in evolution and in the origin of life, and RNA as therapeutic agents. Prerequisites: BCH/BIO 3570-3170 or equivalent with the permission of the program director. Exclusion : CMM 8310.

BCH8366 PhD SEMINAR (3cr.)
Attendance and participation in the annual BMI Student Symposium and BMI Poster Day, attendance at BMI seminars relevant to Biochemistry. Students will present a poster in their first and every alternate year, and an oral presentation the second and every alternate year until they have permission to write their thesis. Graded S/NS

BCH8511 BIOLOGIE DES CHROMOSOMES ET DE LA CHROMATINE (3cr.)
Organisation de la structure des chromosomes et le remodelage de la chromatine ainsi que l’impact de ceux-ci sur la régulation de l’expression génique, la réplication, la réparation et la recombinaison de l’ADN ainsi que sur la ségrégation des chromosomes. Les modifications histoniques et le positionnement des nucléosomes ainsi que leur influence sur la structure organisée des chromosomes. Importance des chromosomes et de la chromatine dans le contexte du cycle cellulaire, du développement et des maladies. Lecture critique de la littérature portant sur la biologie des chromosomes et de la chromatine.

BCH8534 STRUCTURE ET EXPRESSION DES GÉNOMES PROCARYOTES ET EUCARYOTES (3cr.)
Le séquençage des génomes eucaryotes et procaryotes, avec un accent particulier sur les technologies récentes, l’alignement des séquences et les bases de données, et l’assemblage des génomes à partir de données générées par séquençage haut débit. Les études de cartographie comparée incluant les études d’associations pangénomiques basées sur le déséquilibre de liaison pour caractériser les variantes fonctionnelles associées aux traits complexes. L’analyse et la structure de métagénomes microbiens issus d’habitats humains et environnementaux incluant l’analyse structure-fonction des communautés microbiennes, les corrélations entre les maladies humaines et le microbiome ainsi que la phylogénie moléculaire. L’expression génique incluant les mesures de transcriptomes et de protéomes ainsi que l’analyse statistique des données. La combinaison des différentes -données omiques pour comprendre les interactions gène-environnement.

BCH9997 SÉMINAIRE DE RECHERCHE / RESEARCH SEMINAR
À l'intention des étudiants faisant de la recherche en vue de l'obtention du Ph.D. Un séminaire, fondé sur les résultats originaux de leur recherche, doit être présenté par les étudiants avant qu'ils ne commencent à rédiger leur thèse de Ph.D. / For students doing research leading to the doctorate. A seminar, based on the student's original results, to be presented just prior to the writing of the PhD thesis.

BCH9998 EXAMEN DE SYNTHÈSE (DOCTORAT) / COMPREHENSIVE EXAMINATION (PhD)
À l'intention des étudiants inscrits au programme de Ph.D. L'inscription à ce cours est limitée à trois sessions consécutives. / For students enrolled in the doctoral program. Enrollement in this course is limited to three consecutive academic sessions.

BCH9999 RECHERCHE POUR LA THÈSE DE DOCTORAT / DOCTORAL THESIS RESEARCH
À l'intention des étudiants faisant de la recherche en vue de l'obtention du Ph.D. Les étudiants doivent soumettre au Département un plan détaillé de la recherche qu'ils se proposent de faire. Chaque année, une rencontre avec un comité consultatif doit avoir lieu et un rapport de progrès doit être soumis au Département. / For students doing research leading to the doctoral degree. Students are responsible for ensuring that a detailed outline of the proposed research is on file with the Department and that they have an annual meeting with an advisory committee. Yearly progress reports must also be submitted to the Department.

CMM5315 CELLULAR AND MOLECULAR BASIS OF CARDIOVASCULAR FUNCTION/DYSFUNCTION (3cr.)
Mechanism of failing heart and cardiovascular system, its associated functions and associated conditions. Therapies for restoring function. Topics include: regulation of heart development, cell signaling, cellular and molecular mechanisms of atherosclerosis and heart disease, hormonal regulation, hypertension, bioenergetics, cardiovascular genomics and genetics, cell therapy, and regenerative medicine.

MED8166 PROFESSIONALISM AND PROFESSIONAL SKILLS
Basic professional skills related to academic integrity, proper referencing techniques, avoidance of plagiarism, professional etiquette, public speaking, time and stress management, conflict management, teamwork, knowing when and how to access student support services. Compulsory for all students enrolled in master’s or doctoral programs at the Faculty of Medicine. Graded S/NS (Satisfactory/Not satisfactory).

MED8566 ATTITUDE ET COMPÉTENCES PROFESSIONNELLES
Compétences professionnelles de base en matière d’intégrité scolaire, d’usage des références, de vigilance face au plagiat, d’étiquette professionnelle, de présentations orales, de gestion du temps et du stress, de gestion des conflits, de travail d’équipe et de savoir faire à l’égard de l’accès aux services d’appui aux étudiants. Obligatoire pour tous les étudiants inscrits aux programmes de maîtrise ou de doctorat de la Faculté de médecine. Noté S (satisfaisant) ou NS (non satisfaisant).

Coordonnées de l'unité scolaire
Faculté de médecine, Bureau des études supérieures
451, rue Smyth, pièce 2135
Ottawa, Ontario, Canada
K1H 8M5
Tél. : 613-562-5800
Téléc. : 613-562-5365
grad.med@uottawa.ca
http://www.med.uottawa.ca/grad/fra/07-contactez_nous.html